九月底海巡署保護我國漁船在釣魚台附近宣示主權，是近年來難得一見的官民幾近完美合作的案例。讓中國大陸與日本交涉「釣魚島」的強硬表現，反而失去不少光彩，也抵銷了中國大陸想要利用釣魚台爭議，實行統戰的企圖。在這期間，政府國安會、外交部、駐美代表處、陸委會以及海基會，五個主要處理中國大陸關係的單位首長換人，其中多位又是馬總統多年的心腹策士。這是否代表台灣與中國大陸未來四年的政治關係，將有重大的改變？台灣的基督徒應該如何看待未來的兩岸政治關係？
從馬總統過去四年半的大陸政策走向，以及釣魚台爭議的處理方式，可以推測馬政府將來可能會持續推動兩岸經貿文化交流，但是以更堅定的國家主權原則，推動非官方的政治協商。在世界和台灣經濟不景氣的大環境下，馬政府應該還是會把大部分的精力放在經濟發展上。而繼續擴大兩岸的經貿文化交流，有助於帶動台灣經濟脫離谷底。
至於政治協商部分，由於馬總統在2008、2012年總統選舉時，一再表示任內不與中國大陸進行政治談判，因此我們不太可能在未來四年看到兩岸官方公開的政治談判。但是這並不表示馬政府不會透過半官方或民間組織，所謂的第二、第三軌道，進行實質的政治協商。國人大可不必擔心這些檯面下的政治協商，是否會傷害國家主權。畢竟，中華民國是主權獨立的民主國家，任何改變主權的行政措施，都需要立法院的同意，並受到民意的監督。另外，馬總統為了國民黨能夠繼續執政，似乎也沒有必要改變現狀或違反民意趨勢。
台灣的基督徒對於兩岸關係未來的發展，需要有新的思維。過去有部分的教會堅持台灣獨立。殊不知，聖經對於基督徒獨立建國並不支持，因為國家的目標與信徒團體的目標，不能也無法相同。更進一步說，中文聖經裡面關於「國」、「邦」的翻譯，大部分是錯誤的翻譯。這些錯誤翻譯的希伯來原文以及希臘原文，大都是指「民族」、「部族」或「家族」。只是因為華人翻譯者受到清末民初以來的民族主義運動影響，把聖經翻譯成好像到處是關於獨立建國的教導。
中華民國既然是已經實行101年「人的制度」，台灣的基督徒就應該「順服人的一切制度」（彼得前書二章13節）。更何況經過民主化之後，中華民國已經是華人社會自古以來最好的政治體制。我們需不需要跟中華人民共和國統一？這要看對岸是否能夠民主化、尊重人權（尤其是宗教自由），成為「神的用人」（羅馬書十三章4節）。我們期望馬政府未來四年的大陸政策，能夠堅守民主的原則、方法與目標，進一步推動大陸的民主化。將來不論是統一、獨立，或者歐盟式的統合，都不能脫離民意的監督，更不能犧牲兩岸基督徒的宗教自由。
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